Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.4 ms