Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms