Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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TUBB3Q13509 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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TUBB3Q13509 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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TUBB3Q13509 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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TUBB3Q13509 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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TUBB3Q13509 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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