Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 AC007919.2-201ENST00000444110 511 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 EIF2S2P3-201ENST00000428356 999 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 AC114550.1-202ENST00000522661 643 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 AC068389.4-201ENST00000531379 689 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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