Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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