Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 2631.4 ms