Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
IRX1P78414 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
IRX1P78414 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRX1P78414 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRX1P78414 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRX1P78414 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRX1P78414 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRX1P78414 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRX1P78414 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRX1P78414 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRX1P78414 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRX1P78414 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRX1P78414 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRX1P78414 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRX1P78414 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRX1P78414 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRX1P78414 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
IRX1P78414 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRX1P78414 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRX1P78414 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRX1P78414 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRX1P78414 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRX1P78414 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRX1P78414 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRX1P78414 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRX1P78414 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRX1P78414 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRX1P78414 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRX1P78414 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRX1P78414 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRX1P78414 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRX1P78414 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRX1P78414 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRX1P78414 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRX1P78414 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRX1P78414 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRX1P78414 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRX1P78414 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRX1P78414 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRX1P78414 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRX1P78414 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
IRX1P78414 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRX1P78414 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRX1P78414 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRX1P78414 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
IRX1P78414 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRX1P78414 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRX1P78414 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
IRX1P78414 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRX1P78414 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRX1P78414 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRX1P78414 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRX1P78414 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRX1P78414 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRX1P78414 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRX1P78414 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRX1P78414 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
IRX1P78414 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRX1P78414 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRX1P78414 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRX1P78414 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRX1P78414 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRX1P78414 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRX1P78414 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRX1P78414 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRX1P78414 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRX1P78414 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRX1P78414 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRX1P78414 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRX1P78414 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRX1P78414 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRX1P78414 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRX1P78414 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRX1P78414 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRX1P78414 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRX1P78414 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRX1P78414 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRX1P78414 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRX1P78414 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRX1P78414 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRX1P78414 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRX1P78414 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRX1P78414 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRX1P78414 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
IRX1P78414 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRX1P78414 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRX1P78414 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
IRX1P78414 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRX1P78414 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRX1P78414 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRX1P78414 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
IRX1P78414 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRX1P78414 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRX1P78414 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
IRX1P78414 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRX1P78414 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRX1P78414 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRX1P78414 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRX1P78414 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRX1P78414 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.8 ms