Protein–RNA interactions for Protein: P35716

SOX11, Transcription factor SOX-11, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX11P35716 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOX11P35716 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOX11P35716 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOX11P35716 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOX11P35716 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOX11P35716 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOX11P35716 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOX11P35716 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOX11P35716 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOX11P35716 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOX11P35716 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOX11P35716 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOX11P35716 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOX11P35716 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOX11P35716 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOX11P35716 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOX11P35716 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SOX11P35716 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SOX11P35716 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SOX11P35716 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SOX11P35716 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SOX11P35716 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SOX11P35716 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SOX11P35716 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SOX11P35716 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SOX11P35716 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SOX11P35716 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SOX11P35716 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SOX11P35716 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SOX11P35716 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SOX11P35716 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SOX11P35716 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SOX11P35716 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SOX11P35716 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SOX11P35716 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SOX11P35716 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SOX11P35716 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SOX11P35716 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SOX11P35716 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SOX11P35716 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SOX11P35716 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SOX11P35716 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SOX11P35716 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SOX11P35716 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SOX11P35716 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SOX11P35716 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SOX11P35716 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SOX11P35716 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SOX11P35716 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SOX11P35716 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SOX11P35716 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SOX11P35716 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SOX11P35716 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SOX11P35716 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SOX11P35716 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SOX11P35716 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SOX11P35716 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SOX11P35716 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SOX11P35716 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SOX11P35716 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SOX11P35716 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SOX11P35716 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SOX11P35716 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SOX11P35716 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SOX11P35716 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SOX11P35716 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SOX11P35716 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SOX11P35716 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SOX11P35716 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SOX11P35716 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SOX11P35716 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SOX11P35716 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SOX11P35716 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SOX11P35716 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SOX11P35716 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SOX11P35716 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SOX11P35716 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOX11P35716 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SOX11P35716 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOX11P35716 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SOX11P35716 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SOX11P35716 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOX11P35716 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SOX11P35716 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOX11P35716 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SOX11P35716 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOX11P35716 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOX11P35716 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SOX11P35716 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOX11P35716 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SOX11P35716 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SOX11P35716 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SOX11P35716 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOX11P35716 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SOX11P35716 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOX11P35716 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SOX11P35716 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SOX11P35716 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SOX11P35716 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SOX11P35716 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms