Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms