Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms