Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CFTRP13569 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFTRP13569 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CFTRP13569 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CFTRP13569 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CFTRP13569 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFTRP13569 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFTRP13569 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFTRP13569 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFTRP13569 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFTRP13569 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFTRP13569 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFTRP13569 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFTRP13569 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFTRP13569 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFTRP13569 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFTRP13569 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFTRP13569 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFTRP13569 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CFTRP13569 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFTRP13569 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFTRP13569 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFTRP13569 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFTRP13569 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFTRP13569 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFTRP13569 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFTRP13569 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CFTRP13569 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFTRP13569 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CFTRP13569 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFTRP13569 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFTRP13569 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFTRP13569 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFTRP13569 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFTRP13569 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFTRP13569 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFTRP13569 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFTRP13569 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFTRP13569 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CFTRP13569 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFTRP13569 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFTRP13569 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFTRP13569 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFTRP13569 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFTRP13569 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFTRP13569 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFTRP13569 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CFTRP13569 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CFTRP13569 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFTRP13569 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFTRP13569 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFTRP13569 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFTRP13569 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFTRP13569 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFTRP13569 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFTRP13569 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFTRP13569 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CFTRP13569 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CFTRP13569 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFTRP13569 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFTRP13569 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFTRP13569 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFTRP13569 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFTRP13569 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CFTRP13569 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CFTRP13569 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFTRP13569 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFTRP13569 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFTRP13569 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFTRP13569 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFTRP13569 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFTRP13569 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFTRP13569 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CFTRP13569 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFTRP13569 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFTRP13569 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFTRP13569 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFTRP13569 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CFTRP13569 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFTRP13569 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CFTRP13569 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFTRP13569 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFTRP13569 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFTRP13569 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFTRP13569 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFTRP13569 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFTRP13569 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFTRP13569 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFTRP13569 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFTRP13569 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFTRP13569 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFTRP13569 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFTRP13569 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFTRP13569 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFTRP13569 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFTRP13569 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFTRP13569 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFTRP13569 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFTRP13569 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFTRP13569 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.6 ms