Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BMP3P12645 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BMP3P12645 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BMP3P12645 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
BMP3P12645 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BMP3P12645 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BMP3P12645 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
BMP3P12645 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
BMP3P12645 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BMP3P12645 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BMP3P12645 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BMP3P12645 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BMP3P12645 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BMP3P12645 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BMP3P12645 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BMP3P12645 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BMP3P12645 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BMP3P12645 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BMP3P12645 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BMP3P12645 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BMP3P12645 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BMP3P12645 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BMP3P12645 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
BMP3P12645 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BMP3P12645 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BMP3P12645 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BMP3P12645 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BMP3P12645 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BMP3P12645 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BMP3P12645 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BMP3P12645 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BMP3P12645 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BMP3P12645 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
BMP3P12645 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BMP3P12645 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BMP3P12645 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BMP3P12645 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
BMP3P12645 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BMP3P12645 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BMP3P12645 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BMP3P12645 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BMP3P12645 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BMP3P12645 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
BMP3P12645 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BMP3P12645 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BMP3P12645 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BMP3P12645 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BMP3P12645 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BMP3P12645 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BMP3P12645 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BMP3P12645 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BMP3P12645 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BMP3P12645 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BMP3P12645 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BMP3P12645 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BMP3P12645 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BMP3P12645 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BMP3P12645 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BMP3P12645 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BMP3P12645 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BMP3P12645 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BMP3P12645 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BMP3P12645 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BMP3P12645 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BMP3P12645 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BMP3P12645 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BMP3P12645 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BMP3P12645 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BMP3P12645 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
BMP3P12645 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BMP3P12645 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BMP3P12645 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
BMP3P12645 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BMP3P12645 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BMP3P12645 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BMP3P12645 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BMP3P12645 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BMP3P12645 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BMP3P12645 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BMP3P12645 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BMP3P12645 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BMP3P12645 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
BMP3P12645 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BMP3P12645 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BMP3P12645 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BMP3P12645 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BMP3P12645 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BMP3P12645 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BMP3P12645 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BMP3P12645 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BMP3P12645 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BMP3P12645 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BMP3P12645 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BMP3P12645 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BMP3P12645 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BMP3P12645 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BMP3P12645 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BMP3P12645 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BMP3P12645 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
BMP3P12645 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms