Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODC1P11926 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODC1P11926 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODC1P11926 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ODC1P11926 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODC1P11926 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODC1P11926 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODC1P11926 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODC1P11926 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODC1P11926 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODC1P11926 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODC1P11926 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODC1P11926 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ODC1P11926 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODC1P11926 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODC1P11926 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODC1P11926 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODC1P11926 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODC1P11926 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODC1P11926 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODC1P11926 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODC1P11926 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODC1P11926 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODC1P11926 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODC1P11926 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODC1P11926 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ODC1P11926 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODC1P11926 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODC1P11926 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODC1P11926 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODC1P11926 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODC1P11926 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODC1P11926 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODC1P11926 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODC1P11926 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ODC1P11926 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ODC1P11926 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODC1P11926 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODC1P11926 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODC1P11926 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODC1P11926 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODC1P11926 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ODC1P11926 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODC1P11926 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODC1P11926 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODC1P11926 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODC1P11926 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODC1P11926 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODC1P11926 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODC1P11926 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODC1P11926 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODC1P11926 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODC1P11926 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODC1P11926 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODC1P11926 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODC1P11926 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODC1P11926 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODC1P11926 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODC1P11926 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODC1P11926 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODC1P11926 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODC1P11926 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODC1P11926 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODC1P11926 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODC1P11926 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODC1P11926 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODC1P11926 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODC1P11926 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODC1P11926 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODC1P11926 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODC1P11926 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODC1P11926 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODC1P11926 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODC1P11926 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODC1P11926 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODC1P11926 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODC1P11926 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODC1P11926 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODC1P11926 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODC1P11926 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODC1P11926 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ODC1P11926 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODC1P11926 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODC1P11926 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ODC1P11926 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODC1P11926 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODC1P11926 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODC1P11926 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODC1P11926 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODC1P11926 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODC1P11926 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ODC1P11926 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODC1P11926 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODC1P11926 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODC1P11926 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODC1P11926 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODC1P11926 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODC1P11926 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODC1P11926 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODC1P11926 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms