Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATG7O95352 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATG7O95352 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATG7O95352 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATG7O95352 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ATG7O95352 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATG7O95352 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATG7O95352 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATG7O95352 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATG7O95352 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ATG7O95352 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATG7O95352 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATG7O95352 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATG7O95352 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATG7O95352 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATG7O95352 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATG7O95352 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ATG7O95352 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATG7O95352 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATG7O95352 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ATG7O95352 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATG7O95352 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATG7O95352 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATG7O95352 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATG7O95352 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATG7O95352 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ATG7O95352 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATG7O95352 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATG7O95352 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATG7O95352 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATG7O95352 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATG7O95352 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATG7O95352 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATG7O95352 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATG7O95352 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATG7O95352 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATG7O95352 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG7O95352 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG7O95352 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG7O95352 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG7O95352 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG7O95352 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG7O95352 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG7O95352 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG7O95352 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG7O95352 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG7O95352 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG7O95352 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG7O95352 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG7O95352 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG7O95352 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG7O95352 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG7O95352 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG7O95352 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG7O95352 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG7O95352 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG7O95352 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG7O95352 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG7O95352 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG7O95352 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG7O95352 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG7O95352 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG7O95352 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG7O95352 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG7O95352 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG7O95352 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG7O95352 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG7O95352 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG7O95352 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG7O95352 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG7O95352 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG7O95352 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG7O95352 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG7O95352 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG7O95352 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG7O95352 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG7O95352 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG7O95352 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG7O95352 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG7O95352 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG7O95352 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG7O95352 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG7O95352 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG7O95352 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG7O95352 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG7O95352 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG7O95352 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG7O95352 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG7O95352 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG7O95352 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG7O95352 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG7O95352 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG7O95352 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG7O95352 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG7O95352 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG7O95352 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG7O95352 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG7O95352 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG7O95352 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG7O95352 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms