Protein–RNA interactions for Protein: O43731

KDELR3, ER lumen protein-retaining receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR3O43731 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms