Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
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