Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms