Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC11.53□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC11.52□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms