Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms