Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms