Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBH1

PDF, Peptide deformylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDFQ9HBH1 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDFQ9HBH1 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms