Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms