Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms