Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms