Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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GTF2H3Q13889 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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GTF2H3Q13889 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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GTF2H3Q13889 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
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GTF2H3Q13889 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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GTF2H3Q13889 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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GTF2H3Q13889 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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GTF2H3Q13889 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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GTF2H3Q13889 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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GTF2H3Q13889 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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GTF2H3Q13889 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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