Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 LINC01922-201ENST00000562582 719 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms