Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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CALCOCO2Q13137 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
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CALCOCO2Q13137 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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