Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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CSTF3Q12996 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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CSTF3Q12996 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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CSTF3Q12996 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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CSTF3Q12996 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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CSTF3Q12996 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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CSTF3Q12996 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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CSTF3Q12996 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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CSTF3Q12996 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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CSTF3Q12996 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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CSTF3Q12996 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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CSTF3Q12996 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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