Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms