Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms