Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
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