Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms