Protein–RNA interactions for Protein: P43234

CTSO, Cathepsin O, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSOP43234 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSOP43234 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSOP43234 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSOP43234 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSOP43234 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSOP43234 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSOP43234 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSOP43234 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSOP43234 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSOP43234 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSOP43234 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSOP43234 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSOP43234 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSOP43234 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSOP43234 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSOP43234 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSOP43234 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSOP43234 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSOP43234 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSOP43234 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSOP43234 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSOP43234 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSOP43234 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSOP43234 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSOP43234 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSOP43234 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSOP43234 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSOP43234 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSOP43234 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSOP43234 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSOP43234 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSOP43234 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSOP43234 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSOP43234 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSOP43234 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSOP43234 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSOP43234 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSOP43234 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSOP43234 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSOP43234 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSOP43234 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSOP43234 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSOP43234 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSOP43234 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSOP43234 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSOP43234 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSOP43234 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSOP43234 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSOP43234 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSOP43234 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSOP43234 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSOP43234 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSOP43234 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSOP43234 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSOP43234 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSOP43234 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSOP43234 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSOP43234 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSOP43234 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSOP43234 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSOP43234 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSOP43234 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSOP43234 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSOP43234 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSOP43234 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSOP43234 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSOP43234 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSOP43234 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSOP43234 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSOP43234 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSOP43234 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSOP43234 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSOP43234 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSOP43234 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSOP43234 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSOP43234 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSOP43234 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSOP43234 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSOP43234 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSOP43234 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSOP43234 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSOP43234 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSOP43234 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSOP43234 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSOP43234 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSOP43234 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSOP43234 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSOP43234 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSOP43234 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSOP43234 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSOP43234 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSOP43234 IL12A-202ENST00000466512 1283 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSOP43234 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSOP43234 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSOP43234 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSOP43234 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSOP43234 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSOP43234 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSOP43234 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSOP43234 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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