Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA4P35212 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA4P35212 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA4P35212 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA4P35212 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA4P35212 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA4P35212 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA4P35212 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA4P35212 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA4P35212 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA4P35212 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA4P35212 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA4P35212 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA4P35212 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA4P35212 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA4P35212 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA4P35212 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA4P35212 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA4P35212 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA4P35212 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA4P35212 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA4P35212 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA4P35212 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA4P35212 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA4P35212 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA4P35212 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA4P35212 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA4P35212 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA4P35212 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJA4P35212 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GJA4P35212 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJA4P35212 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJA4P35212 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJA4P35212 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJA4P35212 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJA4P35212 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJA4P35212 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJA4P35212 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJA4P35212 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJA4P35212 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJA4P35212 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJA4P35212 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJA4P35212 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJA4P35212 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJA4P35212 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJA4P35212 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJA4P35212 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJA4P35212 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJA4P35212 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJA4P35212 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJA4P35212 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GJA4P35212 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJA4P35212 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GJA4P35212 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GJA4P35212 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJA4P35212 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJA4P35212 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJA4P35212 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJA4P35212 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GJA4P35212 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GJA4P35212 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJA4P35212 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJA4P35212 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJA4P35212 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJA4P35212 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJA4P35212 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJA4P35212 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJA4P35212 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJA4P35212 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJA4P35212 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJA4P35212 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJA4P35212 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJA4P35212 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJA4P35212 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJA4P35212 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJA4P35212 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJA4P35212 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJA4P35212 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA4P35212 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA4P35212 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA4P35212 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA4P35212 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA4P35212 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA4P35212 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA4P35212 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA4P35212 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA4P35212 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA4P35212 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA4P35212 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA4P35212 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA4P35212 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA4P35212 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA4P35212 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA4P35212 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA4P35212 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA4P35212 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA4P35212 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA4P35212 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA4P35212 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA4P35212 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms