Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms