Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP4AP20648 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms