Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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PTPRAP18433 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
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PTPRAP18433 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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PTPRAP18433 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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PTPRAP18433 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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PTPRAP18433 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
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