Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms