Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POP4O95707 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POP4O95707 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POP4O95707 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POP4O95707 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POP4O95707 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POP4O95707 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POP4O95707 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POP4O95707 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POP4O95707 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POP4O95707 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POP4O95707 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POP4O95707 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POP4O95707 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POP4O95707 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POP4O95707 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POP4O95707 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POP4O95707 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POP4O95707 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
POP4O95707 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POP4O95707 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POP4O95707 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POP4O95707 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POP4O95707 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POP4O95707 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
POP4O95707 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POP4O95707 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POP4O95707 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POP4O95707 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POP4O95707 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
POP4O95707 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POP4O95707 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POP4O95707 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POP4O95707 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POP4O95707 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POP4O95707 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POP4O95707 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
POP4O95707 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POP4O95707 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POP4O95707 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POP4O95707 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POP4O95707 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POP4O95707 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POP4O95707 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POP4O95707 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POP4O95707 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POP4O95707 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POP4O95707 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POP4O95707 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POP4O95707 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POP4O95707 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POP4O95707 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POP4O95707 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POP4O95707 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POP4O95707 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POP4O95707 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POP4O95707 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POP4O95707 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POP4O95707 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POP4O95707 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POP4O95707 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POP4O95707 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POP4O95707 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POP4O95707 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POP4O95707 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POP4O95707 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POP4O95707 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
POP4O95707 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POP4O95707 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
POP4O95707 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POP4O95707 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POP4O95707 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POP4O95707 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POP4O95707 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POP4O95707 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POP4O95707 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POP4O95707 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POP4O95707 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POP4O95707 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
POP4O95707 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POP4O95707 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POP4O95707 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POP4O95707 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POP4O95707 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POP4O95707 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POP4O95707 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POP4O95707 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POP4O95707 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POP4O95707 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POP4O95707 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POP4O95707 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POP4O95707 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POP4O95707 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POP4O95707 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POP4O95707 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POP4O95707 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POP4O95707 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POP4O95707 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POP4O95707 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
POP4O95707 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms