Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms