Protein–RNA interactions for Protein: A6NMD2

GOLGA8J, Golgin subfamily A member 8J, humanhuman

Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8JA6NMD2 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA8JA6NMD2 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA8JA6NMD2 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA8JA6NMD2 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA8JA6NMD2 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA8JA6NMD2 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA8JA6NMD2 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA8JA6NMD2 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA8JA6NMD2 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA8JA6NMD2 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA8JA6NMD2 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA8JA6NMD2 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA8JA6NMD2 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA8JA6NMD2 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA8JA6NMD2 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms