Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X1

SNX9, Sorting nexin-9, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX9Q9Y5X1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX9Q9Y5X1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX9Q9Y5X1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX9Q9Y5X1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX9Q9Y5X1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX9Q9Y5X1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX9Q9Y5X1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX9Q9Y5X1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX9Q9Y5X1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX9Q9Y5X1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX9Q9Y5X1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX9Q9Y5X1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX9Q9Y5X1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX9Q9Y5X1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX9Q9Y5X1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX9Q9Y5X1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX9Q9Y5X1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX9Q9Y5X1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX9Q9Y5X1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX9Q9Y5X1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX9Q9Y5X1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX9Q9Y5X1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX9Q9Y5X1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX9Q9Y5X1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX9Q9Y5X1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX9Q9Y5X1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX9Q9Y5X1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX9Q9Y5X1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX9Q9Y5X1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX9Q9Y5X1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX9Q9Y5X1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX9Q9Y5X1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX9Q9Y5X1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX9Q9Y5X1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX9Q9Y5X1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX9Q9Y5X1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX9Q9Y5X1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX9Q9Y5X1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX9Q9Y5X1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX9Q9Y5X1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX9Q9Y5X1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX9Q9Y5X1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX9Q9Y5X1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX9Q9Y5X1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX9Q9Y5X1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX9Q9Y5X1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX9Q9Y5X1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX9Q9Y5X1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX9Q9Y5X1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX9Q9Y5X1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX9Q9Y5X1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX9Q9Y5X1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX9Q9Y5X1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX9Q9Y5X1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX9Q9Y5X1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX9Q9Y5X1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX9Q9Y5X1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX9Q9Y5X1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX9Q9Y5X1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX9Q9Y5X1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX9Q9Y5X1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX9Q9Y5X1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX9Q9Y5X1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX9Q9Y5X1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX9Q9Y5X1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX9Q9Y5X1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX9Q9Y5X1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX9Q9Y5X1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX9Q9Y5X1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX9Q9Y5X1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX9Q9Y5X1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX9Q9Y5X1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX9Q9Y5X1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX9Q9Y5X1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SNX9Q9Y5X1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SNX9Q9Y5X1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SNX9Q9Y5X1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX9Q9Y5X1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX9Q9Y5X1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX9Q9Y5X1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX9Q9Y5X1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX9Q9Y5X1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX9Q9Y5X1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX9Q9Y5X1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX9Q9Y5X1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX9Q9Y5X1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX9Q9Y5X1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX9Q9Y5X1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX9Q9Y5X1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX9Q9Y5X1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX9Q9Y5X1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX9Q9Y5X1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX9Q9Y5X1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX9Q9Y5X1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX9Q9Y5X1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX9Q9Y5X1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX9Q9Y5X1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX9Q9Y5X1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX9Q9Y5X1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX9Q9Y5X1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms