Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B4

SF3B6, Splicing factor 3B subunit 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B6Q9Y3B4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SF3B6Q9Y3B4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SF3B6Q9Y3B4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SF3B6Q9Y3B4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SF3B6Q9Y3B4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SF3B6Q9Y3B4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SF3B6Q9Y3B4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SF3B6Q9Y3B4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SF3B6Q9Y3B4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SF3B6Q9Y3B4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SF3B6Q9Y3B4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SF3B6Q9Y3B4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SF3B6Q9Y3B4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SF3B6Q9Y3B4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SF3B6Q9Y3B4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SF3B6Q9Y3B4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SF3B6Q9Y3B4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SF3B6Q9Y3B4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SF3B6Q9Y3B4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SF3B6Q9Y3B4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SF3B6Q9Y3B4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SF3B6Q9Y3B4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SF3B6Q9Y3B4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SF3B6Q9Y3B4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SF3B6Q9Y3B4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SF3B6Q9Y3B4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SF3B6Q9Y3B4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SF3B6Q9Y3B4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SF3B6Q9Y3B4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SF3B6Q9Y3B4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SF3B6Q9Y3B4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SF3B6Q9Y3B4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SF3B6Q9Y3B4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SF3B6Q9Y3B4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SF3B6Q9Y3B4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SF3B6Q9Y3B4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SF3B6Q9Y3B4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SF3B6Q9Y3B4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SF3B6Q9Y3B4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SF3B6Q9Y3B4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SF3B6Q9Y3B4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SF3B6Q9Y3B4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SF3B6Q9Y3B4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SF3B6Q9Y3B4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SF3B6Q9Y3B4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SF3B6Q9Y3B4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
SF3B6Q9Y3B4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SF3B6Q9Y3B4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SF3B6Q9Y3B4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SF3B6Q9Y3B4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SF3B6Q9Y3B4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SF3B6Q9Y3B4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SF3B6Q9Y3B4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SF3B6Q9Y3B4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SF3B6Q9Y3B4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SF3B6Q9Y3B4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SF3B6Q9Y3B4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SF3B6Q9Y3B4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SF3B6Q9Y3B4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SF3B6Q9Y3B4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SF3B6Q9Y3B4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SF3B6Q9Y3B4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SF3B6Q9Y3B4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SF3B6Q9Y3B4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SF3B6Q9Y3B4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SF3B6Q9Y3B4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SF3B6Q9Y3B4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SF3B6Q9Y3B4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SF3B6Q9Y3B4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SF3B6Q9Y3B4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SF3B6Q9Y3B4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SF3B6Q9Y3B4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SF3B6Q9Y3B4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SF3B6Q9Y3B4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SF3B6Q9Y3B4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SF3B6Q9Y3B4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SF3B6Q9Y3B4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SF3B6Q9Y3B4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SF3B6Q9Y3B4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SF3B6Q9Y3B4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SF3B6Q9Y3B4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SF3B6Q9Y3B4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SF3B6Q9Y3B4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SF3B6Q9Y3B4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SF3B6Q9Y3B4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SF3B6Q9Y3B4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SF3B6Q9Y3B4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SF3B6Q9Y3B4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SF3B6Q9Y3B4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SF3B6Q9Y3B4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SF3B6Q9Y3B4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SF3B6Q9Y3B4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SF3B6Q9Y3B4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SF3B6Q9Y3B4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SF3B6Q9Y3B4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SF3B6Q9Y3B4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SF3B6Q9Y3B4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SF3B6Q9Y3B4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SF3B6Q9Y3B4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SF3B6Q9Y3B4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.7 ms