Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T7

YBX2, Y-box-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX2Q9Y2T7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
YBX2Q9Y2T7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
YBX2Q9Y2T7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
YBX2Q9Y2T7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
YBX2Q9Y2T7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
YBX2Q9Y2T7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
YBX2Q9Y2T7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
YBX2Q9Y2T7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
YBX2Q9Y2T7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
YBX2Q9Y2T7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
YBX2Q9Y2T7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
YBX2Q9Y2T7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
YBX2Q9Y2T7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
YBX2Q9Y2T7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
YBX2Q9Y2T7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
YBX2Q9Y2T7 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
YBX2Q9Y2T7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
YBX2Q9Y2T7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
YBX2Q9Y2T7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
YBX2Q9Y2T7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
YBX2Q9Y2T7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
YBX2Q9Y2T7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
YBX2Q9Y2T7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
YBX2Q9Y2T7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
YBX2Q9Y2T7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
YBX2Q9Y2T7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
YBX2Q9Y2T7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
YBX2Q9Y2T7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
YBX2Q9Y2T7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
YBX2Q9Y2T7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
YBX2Q9Y2T7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
YBX2Q9Y2T7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
YBX2Q9Y2T7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
YBX2Q9Y2T7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
YBX2Q9Y2T7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
YBX2Q9Y2T7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
YBX2Q9Y2T7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
YBX2Q9Y2T7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
YBX2Q9Y2T7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
YBX2Q9Y2T7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
YBX2Q9Y2T7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
YBX2Q9Y2T7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
YBX2Q9Y2T7 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
YBX2Q9Y2T7 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
YBX2Q9Y2T7 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
YBX2Q9Y2T7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
YBX2Q9Y2T7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
YBX2Q9Y2T7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
YBX2Q9Y2T7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
YBX2Q9Y2T7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
YBX2Q9Y2T7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
YBX2Q9Y2T7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
YBX2Q9Y2T7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
YBX2Q9Y2T7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
YBX2Q9Y2T7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
YBX2Q9Y2T7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
YBX2Q9Y2T7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
YBX2Q9Y2T7 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
YBX2Q9Y2T7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
YBX2Q9Y2T7 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
YBX2Q9Y2T7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
YBX2Q9Y2T7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
YBX2Q9Y2T7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
YBX2Q9Y2T7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
YBX2Q9Y2T7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
YBX2Q9Y2T7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
YBX2Q9Y2T7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
YBX2Q9Y2T7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
YBX2Q9Y2T7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
YBX2Q9Y2T7 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
YBX2Q9Y2T7 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
YBX2Q9Y2T7 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
YBX2Q9Y2T7 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
YBX2Q9Y2T7 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
YBX2Q9Y2T7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
YBX2Q9Y2T7 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
YBX2Q9Y2T7 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
YBX2Q9Y2T7 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
YBX2Q9Y2T7 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
YBX2Q9Y2T7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
YBX2Q9Y2T7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
YBX2Q9Y2T7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
YBX2Q9Y2T7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
YBX2Q9Y2T7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
YBX2Q9Y2T7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
YBX2Q9Y2T7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
YBX2Q9Y2T7 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
YBX2Q9Y2T7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
YBX2Q9Y2T7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
YBX2Q9Y2T7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
YBX2Q9Y2T7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
YBX2Q9Y2T7 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
YBX2Q9Y2T7 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
YBX2Q9Y2T7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
YBX2Q9Y2T7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
YBX2Q9Y2T7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
YBX2Q9Y2T7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
YBX2Q9Y2T7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
YBX2Q9Y2T7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
YBX2Q9Y2T7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms