Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
KDM2AQ9Y2K7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
KDM2AQ9Y2K7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
KDM2AQ9Y2K7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
KDM2AQ9Y2K7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
KDM2AQ9Y2K7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
KDM2AQ9Y2K7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
KDM2AQ9Y2K7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
KDM2AQ9Y2K7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
KDM2AQ9Y2K7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
KDM2AQ9Y2K7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
KDM2AQ9Y2K7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
KDM2AQ9Y2K7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
KDM2AQ9Y2K7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
KDM2AQ9Y2K7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
KDM2AQ9Y2K7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
KDM2AQ9Y2K7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
KDM2AQ9Y2K7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
KDM2AQ9Y2K7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
KDM2AQ9Y2K7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
KDM2AQ9Y2K7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
KDM2AQ9Y2K7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
KDM2AQ9Y2K7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
KDM2AQ9Y2K7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
KDM2AQ9Y2K7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
KDM2AQ9Y2K7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
KDM2AQ9Y2K7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC33.21■■■□□ 2.91
KDM2AQ9Y2K7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
KDM2AQ9Y2K7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
KDM2AQ9Y2K7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
KDM2AQ9Y2K7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
KDM2AQ9Y2K7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
KDM2AQ9Y2K7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
KDM2AQ9Y2K7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
KDM2AQ9Y2K7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
KDM2AQ9Y2K7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
KDM2AQ9Y2K7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC33.19■■■□□ 2.9
KDM2AQ9Y2K7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC33.19■■■□□ 2.9
KDM2AQ9Y2K7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
KDM2AQ9Y2K7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
KDM2AQ9Y2K7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
KDM2AQ9Y2K7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
KDM2AQ9Y2K7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
KDM2AQ9Y2K7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
KDM2AQ9Y2K7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
KDM2AQ9Y2K7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
KDM2AQ9Y2K7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
KDM2AQ9Y2K7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
KDM2AQ9Y2K7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
KDM2AQ9Y2K7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
KDM2AQ9Y2K7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
KDM2AQ9Y2K7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
KDM2AQ9Y2K7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
KDM2AQ9Y2K7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
KDM2AQ9Y2K7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
KDM2AQ9Y2K7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
KDM2AQ9Y2K7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC33.16■■■□□ 2.9
KDM2AQ9Y2K7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
KDM2AQ9Y2K7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
KDM2AQ9Y2K7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
KDM2AQ9Y2K7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
KDM2AQ9Y2K7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
KDM2AQ9Y2K7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
KDM2AQ9Y2K7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
KDM2AQ9Y2K7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
KDM2AQ9Y2K7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
KDM2AQ9Y2K7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
KDM2AQ9Y2K7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC33.14■■■□□ 2.9
KDM2AQ9Y2K7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
KDM2AQ9Y2K7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
KDM2AQ9Y2K7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
KDM2AQ9Y2K7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
KDM2AQ9Y2K7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
KDM2AQ9Y2K7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
KDM2AQ9Y2K7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
KDM2AQ9Y2K7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
KDM2AQ9Y2K7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
KDM2AQ9Y2K7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
KDM2AQ9Y2K7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
KDM2AQ9Y2K7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
KDM2AQ9Y2K7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
KDM2AQ9Y2K7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
KDM2AQ9Y2K7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
KDM2AQ9Y2K7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
KDM2AQ9Y2K7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
KDM2AQ9Y2K7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
KDM2AQ9Y2K7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
KDM2AQ9Y2K7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
KDM2AQ9Y2K7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
KDM2AQ9Y2K7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
KDM2AQ9Y2K7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
KDM2AQ9Y2K7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
KDM2AQ9Y2K7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
KDM2AQ9Y2K7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
KDM2AQ9Y2K7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
KDM2AQ9Y2K7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
KDM2AQ9Y2K7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
KDM2AQ9Y2K7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
KDM2AQ9Y2K7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
KDM2AQ9Y2K7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms