Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQR0

SCML2, Sex comb on midleg-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML2Q9UQR0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCML2Q9UQR0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCML2Q9UQR0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCML2Q9UQR0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCML2Q9UQR0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCML2Q9UQR0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SCML2Q9UQR0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCML2Q9UQR0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCML2Q9UQR0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCML2Q9UQR0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCML2Q9UQR0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCML2Q9UQR0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCML2Q9UQR0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SCML2Q9UQR0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SCML2Q9UQR0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SCML2Q9UQR0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SCML2Q9UQR0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCML2Q9UQR0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCML2Q9UQR0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCML2Q9UQR0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCML2Q9UQR0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SCML2Q9UQR0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCML2Q9UQR0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCML2Q9UQR0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCML2Q9UQR0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCML2Q9UQR0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCML2Q9UQR0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCML2Q9UQR0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCML2Q9UQR0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCML2Q9UQR0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCML2Q9UQR0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCML2Q9UQR0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCML2Q9UQR0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCML2Q9UQR0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCML2Q9UQR0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCML2Q9UQR0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCML2Q9UQR0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCML2Q9UQR0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCML2Q9UQR0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCML2Q9UQR0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCML2Q9UQR0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCML2Q9UQR0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SCML2Q9UQR0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCML2Q9UQR0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCML2Q9UQR0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCML2Q9UQR0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCML2Q9UQR0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCML2Q9UQR0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCML2Q9UQR0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCML2Q9UQR0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCML2Q9UQR0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SCML2Q9UQR0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCML2Q9UQR0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCML2Q9UQR0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCML2Q9UQR0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCML2Q9UQR0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCML2Q9UQR0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCML2Q9UQR0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCML2Q9UQR0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCML2Q9UQR0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCML2Q9UQR0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCML2Q9UQR0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCML2Q9UQR0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCML2Q9UQR0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCML2Q9UQR0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCML2Q9UQR0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCML2Q9UQR0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCML2Q9UQR0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCML2Q9UQR0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SCML2Q9UQR0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCML2Q9UQR0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCML2Q9UQR0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCML2Q9UQR0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCML2Q9UQR0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCML2Q9UQR0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCML2Q9UQR0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCML2Q9UQR0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCML2Q9UQR0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCML2Q9UQR0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCML2Q9UQR0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCML2Q9UQR0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCML2Q9UQR0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCML2Q9UQR0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCML2Q9UQR0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCML2Q9UQR0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SCML2Q9UQR0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCML2Q9UQR0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCML2Q9UQR0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCML2Q9UQR0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCML2Q9UQR0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCML2Q9UQR0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCML2Q9UQR0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCML2Q9UQR0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCML2Q9UQR0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCML2Q9UQR0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCML2Q9UQR0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCML2Q9UQR0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SCML2Q9UQR0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCML2Q9UQR0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCML2Q9UQR0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.6 ms