Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ1

TPCN1, Two pore calcium channel protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1Q9ULQ1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TPCN1Q9ULQ1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TPCN1Q9ULQ1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TPCN1Q9ULQ1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TPCN1Q9ULQ1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TPCN1Q9ULQ1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TPCN1Q9ULQ1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TPCN1Q9ULQ1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TPCN1Q9ULQ1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TPCN1Q9ULQ1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TPCN1Q9ULQ1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TPCN1Q9ULQ1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TPCN1Q9ULQ1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TPCN1Q9ULQ1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TPCN1Q9ULQ1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TPCN1Q9ULQ1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TPCN1Q9ULQ1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TPCN1Q9ULQ1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TPCN1Q9ULQ1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TPCN1Q9ULQ1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TPCN1Q9ULQ1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TPCN1Q9ULQ1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TPCN1Q9ULQ1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TPCN1Q9ULQ1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TPCN1Q9ULQ1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TPCN1Q9ULQ1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TPCN1Q9ULQ1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TPCN1Q9ULQ1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TPCN1Q9ULQ1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TPCN1Q9ULQ1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TPCN1Q9ULQ1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TPCN1Q9ULQ1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TPCN1Q9ULQ1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TPCN1Q9ULQ1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TPCN1Q9ULQ1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TPCN1Q9ULQ1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TPCN1Q9ULQ1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TPCN1Q9ULQ1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TPCN1Q9ULQ1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TPCN1Q9ULQ1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TPCN1Q9ULQ1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TPCN1Q9ULQ1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TPCN1Q9ULQ1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TPCN1Q9ULQ1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TPCN1Q9ULQ1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TPCN1Q9ULQ1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TPCN1Q9ULQ1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TPCN1Q9ULQ1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TPCN1Q9ULQ1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TPCN1Q9ULQ1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TPCN1Q9ULQ1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TPCN1Q9ULQ1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TPCN1Q9ULQ1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TPCN1Q9ULQ1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TPCN1Q9ULQ1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TPCN1Q9ULQ1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TPCN1Q9ULQ1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TPCN1Q9ULQ1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TPCN1Q9ULQ1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TPCN1Q9ULQ1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TPCN1Q9ULQ1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TPCN1Q9ULQ1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TPCN1Q9ULQ1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TPCN1Q9ULQ1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TPCN1Q9ULQ1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TPCN1Q9ULQ1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TPCN1Q9ULQ1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TPCN1Q9ULQ1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TPCN1Q9ULQ1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TPCN1Q9ULQ1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TPCN1Q9ULQ1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TPCN1Q9ULQ1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TPCN1Q9ULQ1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TPCN1Q9ULQ1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TPCN1Q9ULQ1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TPCN1Q9ULQ1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TPCN1Q9ULQ1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TPCN1Q9ULQ1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TPCN1Q9ULQ1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TPCN1Q9ULQ1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TPCN1Q9ULQ1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TPCN1Q9ULQ1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TPCN1Q9ULQ1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TPCN1Q9ULQ1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TPCN1Q9ULQ1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TPCN1Q9ULQ1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TPCN1Q9ULQ1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TPCN1Q9ULQ1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TPCN1Q9ULQ1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TPCN1Q9ULQ1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TPCN1Q9ULQ1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TPCN1Q9ULQ1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TPCN1Q9ULQ1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TPCN1Q9ULQ1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TPCN1Q9ULQ1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TPCN1Q9ULQ1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TPCN1Q9ULQ1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TPCN1Q9ULQ1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TPCN1Q9ULQ1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TPCN1Q9ULQ1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
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