Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DENND2AQ9ULE3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DENND2AQ9ULE3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DENND2AQ9ULE3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DENND2AQ9ULE3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DENND2AQ9ULE3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DENND2AQ9ULE3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DENND2AQ9ULE3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DENND2AQ9ULE3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DENND2AQ9ULE3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DENND2AQ9ULE3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DENND2AQ9ULE3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
DENND2AQ9ULE3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
DENND2AQ9ULE3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
DENND2AQ9ULE3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
DENND2AQ9ULE3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
DENND2AQ9ULE3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
DENND2AQ9ULE3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DENND2AQ9ULE3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
DENND2AQ9ULE3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
DENND2AQ9ULE3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
DENND2AQ9ULE3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DENND2AQ9ULE3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
DENND2AQ9ULE3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DENND2AQ9ULE3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DENND2AQ9ULE3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
DENND2AQ9ULE3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
DENND2AQ9ULE3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DENND2AQ9ULE3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DENND2AQ9ULE3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
DENND2AQ9ULE3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
DENND2AQ9ULE3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DENND2AQ9ULE3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
DENND2AQ9ULE3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DENND2AQ9ULE3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DENND2AQ9ULE3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DENND2AQ9ULE3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DENND2AQ9ULE3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DENND2AQ9ULE3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
DENND2AQ9ULE3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DENND2AQ9ULE3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DENND2AQ9ULE3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DENND2AQ9ULE3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DENND2AQ9ULE3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DENND2AQ9ULE3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DENND2AQ9ULE3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DENND2AQ9ULE3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DENND2AQ9ULE3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DENND2AQ9ULE3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DENND2AQ9ULE3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
DENND2AQ9ULE3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
DENND2AQ9ULE3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
DENND2AQ9ULE3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
DENND2AQ9ULE3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
DENND2AQ9ULE3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DENND2AQ9ULE3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DENND2AQ9ULE3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DENND2AQ9ULE3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DENND2AQ9ULE3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DENND2AQ9ULE3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DENND2AQ9ULE3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DENND2AQ9ULE3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DENND2AQ9ULE3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DENND2AQ9ULE3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DENND2AQ9ULE3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DENND2AQ9ULE3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DENND2AQ9ULE3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DENND2AQ9ULE3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DENND2AQ9ULE3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DENND2AQ9ULE3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DENND2AQ9ULE3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DENND2AQ9ULE3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DENND2AQ9ULE3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DENND2AQ9ULE3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DENND2AQ9ULE3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DENND2AQ9ULE3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DENND2AQ9ULE3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DENND2AQ9ULE3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DENND2AQ9ULE3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DENND2AQ9ULE3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DENND2AQ9ULE3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DENND2AQ9ULE3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DENND2AQ9ULE3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DENND2AQ9ULE3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DENND2AQ9ULE3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DENND2AQ9ULE3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DENND2AQ9ULE3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DENND2AQ9ULE3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DENND2AQ9ULE3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DENND2AQ9ULE3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
DENND2AQ9ULE3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DENND2AQ9ULE3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DENND2AQ9ULE3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DENND2AQ9ULE3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DENND2AQ9ULE3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DENND2AQ9ULE3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DENND2AQ9ULE3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DENND2AQ9ULE3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DENND2AQ9ULE3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DENND2AQ9ULE3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms