Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD8

KCNH3, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH3Q9ULD8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNH3Q9ULD8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KCNH3Q9ULD8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KCNH3Q9ULD8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KCNH3Q9ULD8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KCNH3Q9ULD8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KCNH3Q9ULD8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
KCNH3Q9ULD8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KCNH3Q9ULD8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
KCNH3Q9ULD8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCNH3Q9ULD8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCNH3Q9ULD8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCNH3Q9ULD8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCNH3Q9ULD8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCNH3Q9ULD8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCNH3Q9ULD8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNH3Q9ULD8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNH3Q9ULD8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNH3Q9ULD8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNH3Q9ULD8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNH3Q9ULD8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNH3Q9ULD8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNH3Q9ULD8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNH3Q9ULD8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNH3Q9ULD8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNH3Q9ULD8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNH3Q9ULD8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNH3Q9ULD8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNH3Q9ULD8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNH3Q9ULD8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNH3Q9ULD8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNH3Q9ULD8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNH3Q9ULD8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNH3Q9ULD8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNH3Q9ULD8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNH3Q9ULD8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNH3Q9ULD8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNH3Q9ULD8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNH3Q9ULD8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNH3Q9ULD8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNH3Q9ULD8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNH3Q9ULD8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNH3Q9ULD8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNH3Q9ULD8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNH3Q9ULD8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNH3Q9ULD8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNH3Q9ULD8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNH3Q9ULD8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNH3Q9ULD8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNH3Q9ULD8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNH3Q9ULD8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNH3Q9ULD8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNH3Q9ULD8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNH3Q9ULD8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNH3Q9ULD8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNH3Q9ULD8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNH3Q9ULD8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNH3Q9ULD8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNH3Q9ULD8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNH3Q9ULD8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNH3Q9ULD8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNH3Q9ULD8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNH3Q9ULD8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNH3Q9ULD8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNH3Q9ULD8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNH3Q9ULD8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNH3Q9ULD8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNH3Q9ULD8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNH3Q9ULD8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNH3Q9ULD8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNH3Q9ULD8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNH3Q9ULD8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNH3Q9ULD8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNH3Q9ULD8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNH3Q9ULD8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNH3Q9ULD8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNH3Q9ULD8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNH3Q9ULD8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNH3Q9ULD8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNH3Q9ULD8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNH3Q9ULD8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNH3Q9ULD8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNH3Q9ULD8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNH3Q9ULD8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNH3Q9ULD8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNH3Q9ULD8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNH3Q9ULD8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNH3Q9ULD8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNH3Q9ULD8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNH3Q9ULD8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNH3Q9ULD8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNH3Q9ULD8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNH3Q9ULD8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNH3Q9ULD8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNH3Q9ULD8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNH3Q9ULD8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNH3Q9ULD8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNH3Q9ULD8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNH3Q9ULD8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
KCNH3Q9ULD8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms