Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB4

CDH9, Cadherin-9, humanhuman

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH9Q9ULB4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDH9Q9ULB4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDH9Q9ULB4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDH9Q9ULB4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CDH9Q9ULB4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDH9Q9ULB4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDH9Q9ULB4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDH9Q9ULB4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDH9Q9ULB4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDH9Q9ULB4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDH9Q9ULB4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDH9Q9ULB4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDH9Q9ULB4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDH9Q9ULB4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDH9Q9ULB4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDH9Q9ULB4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CDH9Q9ULB4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDH9Q9ULB4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDH9Q9ULB4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDH9Q9ULB4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDH9Q9ULB4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDH9Q9ULB4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDH9Q9ULB4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDH9Q9ULB4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDH9Q9ULB4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDH9Q9ULB4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDH9Q9ULB4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDH9Q9ULB4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDH9Q9ULB4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDH9Q9ULB4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDH9Q9ULB4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDH9Q9ULB4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDH9Q9ULB4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDH9Q9ULB4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDH9Q9ULB4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDH9Q9ULB4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDH9Q9ULB4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDH9Q9ULB4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDH9Q9ULB4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDH9Q9ULB4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDH9Q9ULB4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDH9Q9ULB4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDH9Q9ULB4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDH9Q9ULB4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDH9Q9ULB4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDH9Q9ULB4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDH9Q9ULB4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDH9Q9ULB4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDH9Q9ULB4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDH9Q9ULB4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CDH9Q9ULB4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDH9Q9ULB4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDH9Q9ULB4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDH9Q9ULB4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDH9Q9ULB4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDH9Q9ULB4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDH9Q9ULB4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDH9Q9ULB4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDH9Q9ULB4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CDH9Q9ULB4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDH9Q9ULB4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDH9Q9ULB4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDH9Q9ULB4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDH9Q9ULB4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDH9Q9ULB4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDH9Q9ULB4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDH9Q9ULB4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDH9Q9ULB4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDH9Q9ULB4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDH9Q9ULB4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDH9Q9ULB4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDH9Q9ULB4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDH9Q9ULB4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDH9Q9ULB4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDH9Q9ULB4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDH9Q9ULB4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDH9Q9ULB4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDH9Q9ULB4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDH9Q9ULB4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDH9Q9ULB4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CDH9Q9ULB4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDH9Q9ULB4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDH9Q9ULB4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDH9Q9ULB4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDH9Q9ULB4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDH9Q9ULB4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDH9Q9ULB4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDH9Q9ULB4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CDH9Q9ULB4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDH9Q9ULB4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDH9Q9ULB4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CDH9Q9ULB4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDH9Q9ULB4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDH9Q9ULB4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDH9Q9ULB4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDH9Q9ULB4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDH9Q9ULB4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDH9Q9ULB4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDH9Q9ULB4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDH9Q9ULB4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms